Органически связывая учебные задачи естествознания с его воспитательным значением, методы преподавания — с содержанием учеб-предметов, А.Я. Герд пытался ввести идею исторического развития природы в программы и учебники и обосновал эволюционно биологическое направление в преподавании естествознания. Согласно взгляду А.Я. Герда, учащиеся должны в результате изучения естествознания выработать определенное мировоззрение, в основе которого лежат достижения прогрессивной науки, в частности, учение о саморазвитии мира.

А.Я. Герд написал ряд методических руководств для учителей и учебников для начальной и средней школы. С работой А.Я. Герда по педагогике начальной школы связаны его знаменитые учебные руководства: «Мир божий» и «Предметные уроки», методическое значение которых оказалось, однако, гораздо шире непосредственной задачи, которую ставил себе А.Я. Герд. В своей работе «Александр Яковлевич Герд» Д.И. Трайтак пишет: «Предметные уроки «Земля, воздух и вода» стали образцом продуманного в деталях методического руководства, в котором разработана содержательная система знаний по курсу неживой природы и дана методика начального обучения естествознанию». (СНОСКА: Трайтак Д.И. Александр Яковлевич Герд // Биология в школе. 1988. С.21)

Одной из своих задач А.Я. Герд ставил привлечение народных учителей к изучению родного края. На 71 съезде русских естествоиспытателей и врачей в 1879 г. он говорил, что народные учителя должны быть посредниками между наукой и народом: «Из природы черпает русский народ свои первые знания, в изучении природы лежат средства к его дальнейшему материальному и духовному развитию». (СНОСКА: Герд А.Я. Избранные педагогические труды. М., 1953. С.172)

В главе «Основания, на которых предлагается построить курс предметных уроков в начальной школе» А.Я. Герд указывает: «Начальная школа не развивает в детях достаточного интереса к знанию, потребности и стремления расширить свой кругозор путем чтения и наблюдений, не научает ценить книгу и пользоваться ею как источником дальнейшего образования». (СНОСКА: Герд А.Я. Предметные уроки в начальной школе: Подробное указание как учить детей по книжке «Мир Божий». СПб., 1883. С.1) Ученый констатирует, что главная причина этого недостатка начальной школы в том, что «она не дает почти никаких ценных знаний... она научает детей порядочно читать и писать, но ведь это не знания, а только средства к приобретению знаний. Для того, чтобы воспользоваться этими средствами, нужны и интерес к науке, и некоторое знакомство с методами приобретения знаний, и умение пользоваться книгою и другими средствами обучения. Школа должна дать детям некоторый запас реальных знаний, и, действительно, по возможности сообщать их и в часы, назначенные для объяснительного чтения, и на отдельных, так называемых, предметных уроках. Однако, если спросить учащихся о целях этих уроков, о характере и объеме реальных знаний, какие должны быть сообщены ученикам начальной школы, о методах передачи этих знаний детям, — ответы получите самые разнообразные и в большинстве случаев очень неуверенные». (СНОСКА: Герд А.Я. Предметные уроки в начальной школе: Подробное указание как учить детей по книжке «Мир Божий». СПб., 1883. С.2)