Несколько непохожими являются схемы организации учебного процесса.

В товариществе Балахтинского района основными структурами учебного процесса являются:

§   сборы-погружения, на которых создаются и корректируются индивидуальные учебные планы на четверть, предусматривающие объем учебной деятельности учащихся, формы самостоятельной работы и варианты взаимодействий с учителями; реализуется часть учебных планов, касающаяся профильного ядра и элективных курсов. Таких сборов-погружений в учебном году – четыре;

§   период самостоятельной работы учащегося по реализации собственного учебного плана; в это время, помимо изучения основного ядра предметов старшей школы ученик работает над определенной на сборе частью профильного содержания; рефлексия и коррекция деятельности по реализации индивидуального учебного плана происходит за счет работы постоянного отряда и помощи тьютора.

Учебный процесс в профильной школе Шушенского Простого товарищества предполагает «выездные школы» – один раз в четверть, очные встречи учащихся и учителей (в режиме подвоза к базовой по предмету школе), дистанционного взаимодействия посредством электронной почты во внутрирайонной сети.

Основным элементом, вокруг которого строится учебный процесс, является индивидуальная образовательная программа учащегося. В текстах фигурируют различные названия: индивидуальный учебный план, индивидуальный маршрут и т.д., а по существу индивидуальная образовательная программа – это образ идеального будущего, проект, за реализацию которого взялись участники Простого товарищества. С течением времени происходило изменение представлений об индивидуальных образовательных программах, об их предназначении и содержании.

Взятый участниками Товарищества курс на индивидуализацию учебного процесса потребовал иных организационных форм учебного процесса, иных форм управления им. Учебный процесс во время сборов-погружений и выездных школ проходит в виде коллективных учебных занятий. Учебная группа – сводный отряд, а не класс. За основу организации и управления учебным процессом взята идея самоуправления А.С. Макаренко, адаптированная участниками общественно-педагогического движения «Коллективный способ обучения» для организации коллективных учебных занятий. (СНОСКА: Теория и технология коллективных учебных занятий. Начальный курс : дистанционное учебное пособие / М.А. Мкртчян [и др.]. – Красноярск : Гротеск, 2005. – С. 62-69) Основными структурами управления учебным процессом являются постоянные отряды и Совет командиров.