В то же самое время упорные попытки применить к психиатрии принципы локализации болезни, как они истолковывались Морганьи и Вирховом, предпринимали светила медицинской науки девятнадцатого столетия. То, что психологические функции локализованы в мозге, было известно, по крайней мере в общих чертах, еще врачам Древней Греции. С накоплением знаний по физиологии и анатомии мозга стало возможно локализовать отдельные перцептивные и моторные системы в различных кортикальных и субкортикальных областях мозга. Это, вместе с развитием гистологических методов, породило надежду на то, что к пониманию психических функций и заболеваний можно прийти от знания сложной клеточной структуры мозга (цитоархитектоники). В этом отношении показательны исследования Кайяла, Гольджи, Ниссля, Альцгеймера, Апати, фон Ленхошшека и многих других ученых, благодаря которым была получена детальнейшая информация о гистологической структуре мозга. Эти исследования носили преимущественно описательный характер, функциональное же значение анатомических структур, в особенности высших мозговых центров, оставалось относительно неизвестным. Ни в какой другой медицинской дисциплине не было столь выраженной дихотомии между морфологическим и функциональным знанием, как в области исследования мозга. Где в мозгу протекают мыслительные процессы и эмоции, и как память, воля и разум связаны со структурой мозга — все это было практически неизвестно и даже в настоящее время остается малоизученным.

Именно поэтому многие великие психиатры той эпохи были в первую очередь анатомами мозга, а клиницистами — лишь вторично. В их научной и медицинской деятельности присутствовало тягостное чувство того, что они не могут объединить свои клинические наблюдения со знаниями по анатомии и физиологии мозга. Некоторые из них пытались заполнить этот пробел спекуляциями о психологической значимости структуры мозга — спекуляциями, которые немецкий физиолог Макс Ферворн назвал «мифологией мозга». Дихотомию между морфологическим и физиологическим знанием мозга хорошо иллюстрирует замечание одного физиолога, который, прослушав тщательно подготовленный доклад по гистологической работе Карла Шаффера, знаменитого анатома мозга и психиатра, сказал: «Вы, анатомы мозга, напоминаете почтальона, который знает адреса и фамилии людей, но не имеет представления о том, чем эти люди занимаются».