Один из самых сложных аспектов реализации модели неклассно-урочного обучения — изменение представлений педагогов. Учителю пока сложно понять, что теперь он отвечает за успеваемость ребёнка не только по своему предмету. Педагогам-предметникам сложно отказаться от привычки контролировать каждый шаг ученика. Они без особой на то надобности вмешиваются в самостоятельную и парную работу, отвлекают детей, нарушают запланированный ход учебного процесса. В-третьих, педагоги пока слабо понимают, за счёт чего ученик осваивает разные способы индивидуальной работы. Навыки индивидуальной работы, как и любые другие, первоначально формируются в совместной деятельности, затем присваиваются ребёнком. Если учитель подходит к школьнику, самостоятельно осваивающему некоторый материал, то его первостепенная задача — побудить ученика осмыслить способы учебных действий.

Педагогам не хватает опыта, чтобы составлять индивидуальные планы деятельности школьников: привыкнув писать поурочные планы для класса, они затрудняются в определении потребностей и учебных задач разных учеников. Когда учителя планируют работу с отдельными учащимися, то больше времени уделяют проверке знаний, чем формированию у них способности обучать других, т.е. подготовке своих «заместителей», чтобы самим педагогам к этим темам не возвращаться. Учитель не видит специфику индивидуальной работы с учеником, её отличие от обучения группы детей. Часто педагоги не способны понять всего лишь одного ребёнка. Плохо освоены техники усвоения учебного материала во время индивидуальной работы.

Сложно складывается деятельность учительской кооперации как коллективного субъекта: недостаточен опыт совместного моделирования учебного процесса и программирования своих действий, установления и соблюдения договорённостей, чёткое исполнение во время занятий запланированных функций, позиций. Это связано в том числе и с психологическими аспектами: трудно услышать, понять точку зрения другого, поступиться своими интересами, убеждениями, найти компромисс, оказать полное доверие коллеге. Срабатывает стереотип: «Я это сделаю лучше, чем другой».