·         Система первичного изложения знаний (в учебных текстах учебника и учителя) построена на основе логических связей между отдельными частями содержания предъявляемого материала. Такой системе характерны линейные связи. Все знания в учебнике рядоположены, их единицей по существу является параграф. Последовательность разворачивания материала может быть вариативной, важно чтобы последующие знания опирались на предыдущие. Логика изложения определяется структурой методической системы. Как результат в сознании формируются систематические знания со структурой, адекватной системе первичного изложения и связями между отдельными частями содержания.

·         Итоговая система в сознании ученика. Она непосредственно принципиально не наблюдаема. В сознании она отображается в некоторой нелинейной модели. Л.Я. Зорина рассматривает трехслойную (понятия, постулаты и законы, следствия) схему отображения теории – форму хранения в сознании содержания научной теории, соответствующего её структуре. Каждый слой объединяет независимые, рядоположенные знания. Слои связаны между собой отношениями иерархии, подчинения. У учащегося, обладающего системными знаниями, между ними установлены инвариантные знания.

·         Система изложения учеником итоговых знаний. Характерны линейные связи, поскольку всякое изложение может быть только линейным. Они отличаются от системы первичного изложения знаний; связи между элементами фрагмента знания определяются видом учебного знания как целого (закон, понятие и т.п.) и целью его изложения. Связи между элементами этой структуры инвариантны. Логика изложения определяется структурой дидактической теории (там же, с. 22-29).

Если в учебном процессе не предусмотреть специальных мест и процедур, за счёт которых каждый ученик устанавливает системные связи, то как правило, в голове ученика будет набор фрагментарных знаний, не дающих целостной картины изучаемого предмета.