По возвращении в Россию Н. М. Лаговский издал ряд сурдопедагогических работ. Первой из серии его книг была «Королевское училище глухонемых в Берлине», в которой давалось подробное описание процесса обучения глухонемых в этом училище. Одновременно появилась и его «Книга рассказов для классного чтения и бесед с глухонемыми детьми старшего возраста». Это было первое пособие для учителей глухих и глухих учеников старших классов, если не считать в значительной мере устаревшую к тому времени книгу Г. А. Гурцова «Энциклопедический курс» и «Хрестоматию» И. Я. Селезнева. В 1903 году вышла работа Н. М. Лаговского «Обучение глухонемых устной речи», которая в дореволюционный период выдержала два издания и стала настольной книгой для учителей глухих. Она была значительно шире по содержанию, чем ранее издававшиеся методики по обучению глухих произношению и русскому языку А. Ф. Остроградского и И. А. Васильева.

В трудах Н. М. Лаговского центральное место занимали и вопросы обучения устной речи. По своим приемам методика Н. М. Лаговского была сходна с методикой А. Ф. Остроградского. Но в отличие от А. Ф. Остроградского Н. М. Лаговский излагал содержание обучения звуковой речи в определенной системе по годам обучения. Он значительно шире и разностороннее, чем А. Ф. Остроградский, раскрывал анатомо-физиологические характеристики слухоречевого аппарата глухого человека и его возможности в восстановлении, в постановке звуков русского языка. В методике постановки звуков Н. М. Лаговский шел от более видимых и осязаемых к звукам менее «наглядным» и «ощущаемым».

Н. М. Лаговский видел в правильном домашнем воспитании глухих средство к сохранению его устной звуковой речи после наступления глухоты. Тем самым облегчалось усвоение им словарного состава и грамматики русского языка в школе.

В Петербургском училище Н. М. Лаговский проработал до осени 1910 года. С сентября этого года он взял на себя заведование четырьмя учреждениями для глухих в г. Александровске (Запорожье), объединенными в училище-хутор. Здесь Н. М. Лаговский вел напряженную сурдопедагогическую деятельность. В Александровском хуторе он объединил вокруг себя творческий коллектив учителей и воспитателей для решения намеченных им педагогических задач по обучению и воспитанию глухих детей. Среди них были сестры О. Комир и М. Комир, И. А. Соколянский и многие другие талантливые сурдопедагоги. Но Н. М. Лаговскому в Александровском хуторе не удалось осуществить многие из своих педагогических идей не только потому, что они были противоречивы, но и потому, что в условиях дореволюционной России они были утопичны. Н. М. Лаговский правильно считал, что начинать обучение глухих необходимо с дошкольного возраста и продолжать до включения их в трудовую деятельность. Но вся организация жизни этого училища страдала пороками, проистекавшими из народнических идей и прожектов.