1. Отсутствие математического описания и необходимость его разработки для решения задач управления.

2. Нестационарность, вызванная сложностью объекта управления и проявляющаяся в дрейфе характеристик системы, в изменении ее параметров, в эволюции объекта управления и управляющей системы во времени.

3. Стохастичность поведения, вызванная не столько наличием каких-то специальных случайных помех в системе, сколько (в силу ее сложности) неизбежным обилием всякого рода второстепенных ( с точки зрения целей управления, разумеется) процессов.

4. Уникальность и непредсказуемость поведения системы в конкретных условиях, невоспроизводимость экспериментов, проявляющиеся в различной реакции объекта управления на одну и ту же ситуацию или управляющее воздействие в различные моменты времени (сложный развивающийся объект управления и сама управляющая система все время как бы перестают быть сами собой). Но в то же время наличие у управляющей системы и объекта управления свойств эквифинальности и предела потенциальной эффективности при имеющихся ресурсах (элементах, их свойствах) и характерных для системы структурных связях.

5. Способность адаптироваться к изменяющимся условиям как по отношению к внешним и внутренним помехам, нарушающим нормальное функционирование системы, так и к управляющим воздействиям (негативность к управлению), что обусловлено наличием активных элементов в системе.

6. Способность и стремление к целеобразованию: в отличии от замкнутых (закрытых технических) систем, которым цели задаются извне, в открытых системах с активными элементами цели формируются внутри системы, и если не организовать в системе процесс целеобразования, базирующийся на взаимодействии внешних и внутренних факторов, то цели (если их пытаться навязать системе, как внешние требования подобно техническим замкнутым системам) не будут выполнять своей активной роли в управлении АС.

7. Способность изменять свою структуру, сохраняя целостность, формировать варианты поведения, а также противостоять энтропийным, разрушающим систему тенденциям, что обусловлено отсутствием у систем с активными элементами, стимулирующими обмен материальными, энергетическими и информационными продуктами со средой, закономерности возрастания энтропии.

8. Неоднозначность таких понятий, как "система" и "подсистема", "цель" и "средство", объясняющаяся закономерностями коммуникативности (у любой системы имеется надсистема и подведомственная по отношению к ней система, с которой она взаимодействует) и иерархичности (основное свойство иерархической системы состоит в том. что каждый уровень является подсистемой по отношению к вышележащему и системой по отношению к нижележащему и соответственно средством по отношению к вышележащему и целью по отношению к нижележащему уровню).