Из всех известных методик патопсихолог выбирает 8-10 (или большее количество, если этого требуют обстоятельства), которые помогут наиболее полно раскрыть цель обследования и ответить на поставленные лечащим врачом вопросы. При выборе методик необходимо учитывать возраст, образование больного, его культурный уровень, эрудицию, круг интересов, потребности и жизненный опыт. Варианты методик, порядок их предъявления, полнота обследования могут и должны варьироваться в зависимости от целей, задач и индивидуальности больного.

Выполнению заданий по каждой методике предшествует инструкция. От инструкции зависит то, насколько больной поймет и выполнит задание. Поэтому инструкция должна быть лаконичной и понятной, предъявляться четко, по установленной форме. Небрежная, плохо сформулированная инструкция может быть причиной неправильного ее понимания и, в конечном счете - искажения результатов. При необходимости в начале работы инструкцию можно пояснить одним-двумя примерами. Когда в ходе деятельности больного выявляется потребность в помощи, важно определить, насколько эффективной она, оказывается, принимается ли испытуемым или отвергается. Все эти наблюдения очень важны для анализа результатов и составления заключения. Экспериментально-психологическое исследование может быть также направлено на решение некоторых теоретических задач, которые, однако, имеют большое значение для клинической практики. В этом случае психолог выделяет и ставит в центр своего внимания один какой-либо процесс или качество и целенаправленно изучает его во всей полноте и объеме в специально созданных условиях и с помощью соответствующих методов.

Тщательное протоколирование обследования - неотъемлемое условие проведения эксперимента. Протокол начинается с заполнения титульного листа, который включает в себя паспортные данные, семейное положение больного, дату и цель обследования, предварительный диагноз, предъявляемые жалобы, наиболее значимые сведения из истории болезни. Кроме этих сведений на титульном листе обозначают отделение, количество приемов и методики, с помощью которых обследовался больной. Здесь же можно делать записи о поведении больного и его отношении к исследованию. Записи ведутся так, чтобы больной не мог их видеть и прочитать.