Для А.Я. Герда сущность преподавания заключается не в описании явлений, а в объяснении их, в понимании важнейших процессов жизни, где все живое необходимо изучать в развитии, росте. А.Я. Герд стремился перестроить курс естествознания в средней школе на принципах эволюционного учения, так как до него эволюционная теория не коснулась школьных программ и учебников. Через все его руководства, методические статьи и программы проходит идея развития, продуманное и обоснованное эволюционно-экологическое направление. Учащиеся добыли познакомиться с развитием науки от Линнея, Кювье, Лайеля до Дарвина.

Будучи эволюционистом, переводчивом Ч. Дарвина, А.Я. Герд поставил своей задачей подготовить учащихся к восприятию этого учения в течение всего курса естествознания. Достигалась эта задача рядом способов. Во-первых, весь курс, начиная с раздела о неживой природе, строился в эволюционной последовательности. Во-вторых, внутри отдельных предметов (ботаники, зоологии) был принят восходящий порядок — от низших организмов к высшим. Заканчивалось изучение курса особым предметом, который А.Я. Герд в своей программе назвал «Историей земли». Этот раздел, по сути, представлял краткий курс дарвинизма, построенный на учебном материале предыдущих лет, но с введением элементов геологии и космографии. В раздел входили вопросы: возникновение небесных светил; происхождение солнечной системы, образование земного шара; развитие растений и животных в их исторической последовательности. (СНОСКА: Герд А.Я. Избранные педагогические труды. М., 1953. С.181)

План преподавания А.Я. Герда варьировался в зависимости от того, был ли он рассчитан на курс реальных гимназий, где естествознанию отводилось большее число часов, или предназначался для начальных школ, где обучение было трехгодичным. В первом случае А.Я. Герд советовал вести преподавание попредметно (минералогия, ботаника, зоология). Во втором — не производить такого расчленения, но дать комплексный курс неорганического и органического мира. Программа, составленная А.Я. Гердом для начальной школы, была рассчитана на 100 часов (50 в среднем отделении и 50 в старшем). В среднем отделении изучался неорганический мир, в старшем — по разделам (растения, животные, человек) рассматривался органический мир. Большое внимание было обращено на значение природы для человека, показывалась роль человека по овладению ресурсами страны. В курсе неживой природы предлагалось рассматривать различные производства: стекольное, гончарное и др.