Следует иметь в виду, что транссексуализм - стремление к иной половой идентичности, и поэтому чаще всего прямо не связан с сексуальной ориентацией и удовлетворением соответствующего полового влечения. Это, прежде всего желание, утвердиться и быть принятым в обществе как человек другого пола.

Транссексуализм проявляется в детстве, но его трудно распознать до определенного возраста, принято считать, что трансформации подвергаются обычно люди в возрасте от 21 до 35 лет.

В настоящий момент Международной ассоциацией по изучению половой дисфории (состояние, при котором человек выражает неудовлетворенность своим полом) им. Г. Бенджамина выработаны критерии обследования людей, добивающихся сменой пола. Необходимым условием для этого является стабильное половое самосознание, которое предопределяет длительное существование стремления изменить пол (не менее двух лет), В настоящее время полагают, что существуют множественные причины несовпадения половой идентичности и биологических особенностей, предопределяющих пол человека. Биология закладывает лишь фундамент этого явления, но далее многое зависит от конкретных социальных, психологических и физиологических условий.

Значительное влияние на вероятность возникновения транссексуализма имеет пренатальный стресс, что установлено на лабораторных животных.

В случаях, когда беременные крысы подвергались воздействию яркого света, у мужских особей в дальнейшем подавлялась продукция тестостерона. Такие крысы чаще вели себя, как самки, особенно если им давали прогестерон и эстрадиол. При этом уменьшался размер медиальной преоптической области гипоталамуса, ответственной за мужское половое поведение.