Согласно современным воззрениям, в основе стенокардии могут лежать различные механизмы. Так, в одних случаях это спазм коронарных сосудов, в других — избыточное поступление в кровяное русло из надпочечников катехоламинов: адреналина и нарадреналина. Последний, быстро поглощаясь сердечной мышцей, может привести к усиленному потреблению кислорода и вследствие этого возникновению относительной недостаточности кровоснабжения и ишемии миокарда. Возможно, что при стенокардии аутогенная тренировка может, во-первых, вызывать расширение коронарных сосудов, во-вторых, устраняя эмоциональную напряженность, уменьшать выделение катехоламинов надпочечниками. При лечении этим методом больных стенокардией опасность заключается в том, что они, перестав ощущать боль, могут недооценить тяжесть своего состояния. Возможность же неблагоприятного течения сердечного заболевания при применении этого метода, как мы убедились, не исключается и необходимость соблюдения соответствующего режима остается в силе. Вероятно поэтому Miiller-Hegemann считает нецелесообразным применение аутогенной тренировки при тяжелых сердечных заболеваниях (например, грудной жабе).

Некоторые авторы отмечали положительный симптоматический результат при лечении аутогенной тренировкой центральных, спастических параличей (при вялых, периферических параличах эффекта не наблюдается), спинной сухотки (улучшение чувствительности), рассеянного склероза, паркинсонизма (смягчение судороги взора), привычного выкидыша, легкого тиреотоксикоза, глаукомы, нейродермитов. Мы наблюдали устранение с помощью этого метода лишь функционально обусловленных симптомов.

Применяется аутогенная тренировка также для борьбы с дурными привычками — онанизмом, сутулостью, привычкой грызть ногти [формула: «Едва рука потянется к волосам (рту, половым органам) она сама опустится (отдернется)]». При лечении онанизма, кроме того, стремятся сократить время пребывания ребенка в постели перед засыпанием. Поэтому Oles рекомендует за полчаса до сна давать снотворное, далее заменять его представлением: «Я очень устал и засыпаю». Ruck, применявший аутогенную тренировку для лечения функциональных психогенных и непсихогенных нарушений, положительный эффект отмечал в 70% случаев.