Лечение внушением в состоянии гипнотического сна противопоказано больным, склонным к бредовым идеям отношения и воздействия, в частности гипнотического (шизофрения и другие психозы), так как может привести к укреплению этих идей и включению гипнотерапевта в бредовую систему.

Недостатком метода является то, что он направлен обычно лишь против какого-либо болезненного симптома, не устраняя причины заболевания. Терапевтический эффект более стоек, когда внушение в состоянии гипнотического сна сочетается с другими видами психотерапии, в частности с лечением убеждением, а иногда и каузальной психотерапией. Кроме того, недостатком метода является то, что далеко не всех больных удается погрузить в гипнотический сон.

Внушения, сделанные в состоянии сомнамбулизма, обычно более действенны. Однако несомненно, что хорошие терапевтические результаты могут быть полечены и при лечении внушением в состоянии легкого гипнотического сна и даже наяву. Некоторые авторы, применявшие лечение внушением в гипнотическом сне, постепенно отказались от этого метода и перешли на лечение внушением наяву, так как достигали в последнем случае такого же терапевтического эффекта, как и в первом.

Другие авторы считают недостатком гипноза то, что он овеян ореолом чего-то мистического, загадочного и поэтому применение его якобы нецелесообразно. Это возражение не выдерживает критики, так как при правильном разъяснении сущности гипноза существующие предрассудки могут быть устранены. Во всяком случае наличие их само по себе не служит поводом для отказа от применения гипнотерапии, а может являться лишь основанием для борьбы с этими предрассудками.

Указывается, что больной может попасть в слишком большую зависимость от гипнотизера. Однако больной в состоянии гипнотического сна не является безвольным автоматом, игрушкой в руках гипнотизера. Применение гипнотерапии по медицинским показаниям и допущение к проведению ее, согласно инструкции Наркомздрава РСФСР от 1926 г., только врачей устраняет указанную опасность. По окончании курса гипнотерапии легко поддающимся гипнотизации больным желательно внушить, что они смогут быть погружены в гипнотический сон в дальнейшем только врачом и не уснут, если их попытается гипнотизировать не врач. Практически значительно большую опасность применение гипноза представляет не для больного, а для врача, так как он может стать жертвой ложных обвинений в использовании этого метода в корыстных целях. Эротические сновидения, которые иногда могут возникать у больных во время гипнотического сна и приниматься ими за действительность, могут дать повод для ложного обвинения врача в попытке изнасилования. К этому же иногда может привести и склонность истероидных психопатов к лживости и вымыслам. Для ограждения врача от подобных обвинений сеансы гипноза, согласно инструкции, разрешается проводить лишь в лечебных учреждениях, причем желательно в присутствии третьего лица. Данные о сеансе лучше заносить в специальную тетрадь.