По А. А. Меграбяну и М. А. Мелик-Пашаяну, с углублением гипнотического она наступает сдвиг фаз колебаний биопотенциалов между лобной и затылочными областями коры головного мозга от 180° к 0°. Синфазность раньше возникает в правом полушарии, чем в левом. Если она становится более резкой слева, то обычно наступает утрата раппорта и переход гипнотического сна в естественный. Очевидно, раппорт связан с наличием концентрированного возбуждения в левом полушарии, в речедвигательном анализаторе.

Чешский исследователь Krakora отмечает, что у субъектов, находящихся в состоянии гипнотического сна, пока гипнотизер говорит или пока они выполняют какие-либо приказания, электроэнцефалограмма такая же, как и у бодрствующих. Через некоторое время после последнего внушения появляется запись, типичная для нормального сна, хотя раппорт не утрачивается. Она возникает и в тех случаях, когда загипнотизированный длительно сохраняет приданное ему положение. Эти наблюдения свидетельствуют, по мнению автора, о нестойкости глубины торможения во время гипнотического сна. По нашим данным, в начале гипнотизации отчетливо выступает альфа-ритм, что характерно для состояний бодрствования (покоя). При погружении больных в глубокий гипнотический сон ритм волн несколько замедляется. Кривая электроэнцефалограмм все же близка к таковой в состоянии бодрствования. Лишь при оставлении больного в состоянии гипнотического сна значительное время без производства каких-либо внушений появлялась запись, характерная для неглубокого естественного сна. Если на электроэнцефалограмме альфа-ритм исчезает и начинают доминировать медленные волны, т. е. возникает картина, характерная для глубокого естественного сна, раппорт утрачивается. Во время как естественного, так и гипнотического сна при электроэнцефалографическом исследовании с применением ритмических световых раздражений обнаруживается снижение уровня лабильности корковых нейронов.

В пользу взгляда на гипноз как на частичный сон говорит то, что если загипнотизированного человека оставить в таком состоянии и не поддерживать с ним раппорта, то вскоре гипнотический сон переходит в обычный без сторожевого пункта. Из этого состояния сна испытуемый может быть либо выведен обычными приемами, которыми пробуждают спящих естественным сном, либо через некоторое время он выходит из него самостоятельно.