Ножки мозга располагаются вентральнее крыши среднего мозга. Ножки мозга выглядят в виде толстых округлых тяжей белого цвета, выходящих из моста и направляющихся вперёд, вверх и немного в стороны друг от друга к полушариям большого мозга (см. рис. 26, 27). Между ножками находится межножковая ямка, на дне которой видно заднее продырявленное вещество. На медиальной поверхности каждой ножки выходит глазодвигательный нерв (III пара).

На фронтальных разрезах ножек мозга различают две части (рис. 33): вентральную (основание ножки мозга) и дорсальную (покрышку ножки мозга). Границей между ними является чёрное вещество, состоящее из клеток, содержащих темный пигмент меланин.

Основания ножек мозга образованы нервными волокнами двигательных пирамидных путей, идущими от коры большого мозга к двигательным ядрам моста, продолговатого и спинного мозга.

Покрышки ножек мозга содержат, главным образом, восходящие (чувствительные) проводящие пути, направляющиеся к таламусу, а также крупные и мелкие скопления нейронов – ядра покрышки среднего мозга. Между покрышками правой и левой ножек мозга, медиально, располагаются перекрёсты покрышки. Они образованы пучками волокон красноядерно-спинномозгового, красноядерно-ретикулярного и покрышечно-спинномозгового путей, переходящих на уровне среднего мозга на противоположную сторону.

Большинство ядер покрышки (кроме срединного) являются парными – по одному в каждой покрышке ножек среднего мозга. Самыми крупными из ядер покрышки являются: 1) красные ядра, расположенные в центре покрышек, 2) ядра глазодвигательных нервов (III пара), расположенные дорсальнее красных ядер. Вокруг водопровода мозга располагаются 3) ядра блоковых нервов (IV пара), 4) парное добавочное вегетативное (Якубовича), 5) ядра среднемозгового пути тройничного нерва (V пара), 6) промежуточные ядра дорсального продольного пучка и 7) ретикулярная формация.