В практике сегодняшней классно-урочной системы можно у разных авторов обнаружить разные структуры программ по одному и тому же предмету. Но они подчинены именно классно-урочному обучению. В педагогической практике есть разные маршруты в изучении одного и того же предмета, но это маршруты для целых классов, а не для отдельных детей в учебной группе. Одна программа — один для всех маршрут. Результаты наших исследований свидетельствуют о том, что другой тип учебного процесса — обучение в разновозрастных учебных группах — диктует особую структуру учебных программ: нелинейную и не разделённую на классы, а развёрнутую объёмно, что позволяет получить многообразие программ, для каждого ученика — свою. Это требует от учителей хорошей предметной подготовки.

На третьем этапе предполагается стандартизация получаемых образцов новых школ и способов их переноса, тиражирование и адаптация моделей малокомплектной школы неклассно-урочного типа во всех территориях края. Для создания новой педагогической практики особую роль приобретают районные и межрайонные сети взаимодействующих школ.

Осуществляя дальнейшие шаги по реализации проекта, мы обращаем особое внимание на деятельность основного субъекта преобразований школы — директора. При проектировании многие из них пока не видят собственную роль, других субъектов преобразований, слабо контактируют с ними. Отсутствие целостных представлений об обучении в разновозрастных учебных группах, а отсюда и отсутствие конкретного проекта преобразования своей школы обусловлены тем, что довлеют привычные стереотипы. Субъект должен соответствовать масштабу преобразований.