Эстрогены, называемые женскими половыми гормонами, также вырабатываются у женщин (яичниками), у мужчин (яичками). Эстрогены обеспечивают нормальное состояние, развитие и функционирование слизистой влагалища и функцию молочных желез. В то же время эстрогены не влияют на уровень сексуального влечения женщины, о чем свидетельствуют немалочисленные факты сохраняющегося сексуального влечения у женщин, перенесших оперативное удаление яичников. Роль эстрогенов в мужском организме до конца не изучена, известно лишь, что его избыток в организме мужчины снижает сексуальное влечение и активность и приводит к нарушениям эрекции

Руководство половыми железами внутренней секреции осуществляет структура подкорки мозга — гипоталамус. Гормоны повышают чувствительность нервной системы, ее готовность реагировать на сексуальные стимулы. Уровень концентрации в крови ряда гормонов и прежде всего тестостерона обусловлен возрастом, временем суток и другими причинами. В последние годы стало известно, что сексуальное влечение зависит не столько от уровня общей концентрации в крови тестостерона, сколько от индекса свободного тестостерона, т. е. его отношения к глобулину, который связывает тестостерон. Именно свободный тестостерон обеспечивает биологический компонент либидо. Такие сексуальные реакции как ночные поллюции и утренние эрекции соответствуют максимальному уровню свободного тестостерона у мужчин именно в это время суток.

Удаление половых желез всегда сопровождается снижением сексуальности. Сначала постепенно снижается либидо, затем — у мужчин — появляется отсутствие семяизвержения в половом акте, ослабляется и исчезает эрекция. У женщин на фоне снижения влечения наступает аноргазмия, а потом фригидность.

У женщин выраженность сексуального влечения тоже определяется количеством андрогенов. Гинекологами давно отмечено, что применение андрогенов при лечении различных гинекологических заболеваний в качестве побочного эффекта вызывает усиление влечения. Влияние кастрации на сексуальность у женщины иное, чем у мужчины. Последствия кастрации почти никак не отражаются на ее сексуальной активности (собственно, как и климакс). Происходящие изменения чаще объясняются не гормональными, а социально-психологическими причинами (переживанием собственного увядания, стремлением соответствовать принятым в обществе штампам и т. п.).