Несмотря на специфические полномочия тех или иных государственных органов в сфере охраны окружающей среды, в деятельности по охране окружающей среды должны принимать участие все без исключения - исходя из основного принципа охраны окружающей среды, установленного в ст. 3 Федерального закона "Об охране окружающей среды". Основными принципами являются: обязательность участия в деятельности по охране окружающей среды органов государственной власти Российской Федерации, органов государственной власти субъектов Российской федерации, органов местного самоуправления, общественных и иных некоммерческих объединений, юридических и физических лиц; участие граждан, общественных и иных некоммерческих объединений в решении задач охраны окружающей среды, международное сотрудничеств РФ в области охраны окружающей среды.

Несомненно, главным государственным органом, исполняющим объем федеральных полномочий в области охраны окружающей среды, является Министерство природных ресурсов Российской Федерации (МПР России).

Действующее положение о Министерстве природных ресурсов Российской Федерации утверждено постановлением Правительства РФ от 22 июля 2004 г. N 370 с изм. от 30 июля 2004 г. N 400. Весна и лето 2004 г. в Российской Федерации ознаменовались проведением административной реформы, в результате которой были реорганизованы, упразднены действующие органы федеральной власти и сформированы новые федеральные органы исполнительной власти и утверждены положения о них. МПР России сегодня подведомственны: Федеральная служба по надзору в сфере природопользования (Положение утверждено постановлением Правительства РФ от 30 июля 2004 г. N 400), Федеральное агентство водных ресурсов (Положение утверждено постановлением Правительства РФ от 16 июня 2004 г. N 282 с измен. от 30 июля 2004 г. N 401), Федеральное агентство лесного хозяйства (Положение утверждено постановлением Правительства РФ от 16 июня 2004 г. N 283), Федеральное агентство по недропользованию (Положение утверждено постановлением Правительства РФ от 17 июня 2004 г. N 293).