Перед Второй Мировой Войной биолог и математик Людвиг фон Берталанффи представил Общую Теорию Систем, в которой попытался определить принципы, универсальные для всех систем в природе. В строгом смысле слова Общая Теория Систем использует математику, чтобы определить принципы, относящиеся к системам вообще. Термин "система" в этом контексте относится к функционированию организмов или групп, которые рассматриваются как единая сущность, а не сумма частей.

Как теоретическая система взглядов, Общая Теория Систем нашла своё использование в разных сферах, давая новое понимание старым фактам и открывая новые возможности для осмысления. Такие понятия как "гомеостаз", "энтропия", "открытые" и "закрытые" системы стали применяться и на уровне индивидуума, и на уровне семьи, группы, организации. В своих исследованиях Боуэн тоже использовал слово "система". В публикации 1966 года он объяснял, что "семья является системой, так как изменения в одной части ведут к компенсаторным изменениям в других частях семьи". В этом смысле принцип действия семейных систем, схож с известными природными системами, такими, как сердечно-сосудистая система человека. В 1975 году, Боуэн добавил свое собственное имя к исходному названию Семейной Системной Теории, чтобы избежать неточности в общем употреблении слова "система".

Боуэновская Теория Систем и Общая Теория Систем имеют схожие сферы, однако, происходят из разных источников. Как отмечалось ранее, Общая Теория Систем получила своё начало от осмысления результатов развития математики и кибернетики. Боуэновская Теория Систем базируется на фактическом знании, почерпнутом из наблюдения за человеческой семьей.

Расширяя перспективы, Боуэн пытался увидеть системные процессы, которые управляют эмоциональным поведением человека. Он считал, что наука о человеке сможет занять достойное место среди других естественных наук. Поэтому особенное внимание уделялось терминам, которые использовались в описании его работы. Язык Боуэновской теории большей частью взят из биологии и используется в идентичном или схожем смысловом значении.